Doctorado en Fisicoquímica Molecular UNAB realizó el taller “Herramientas Avanzadas en Simulación Biomolecular”

En el marco de las actividades académicas del Programa de Doctorado en Fisicoquímica Molecular y del Centro de Investigación para el Diseño de Materiales (CEDEM) de la UNAB, se llevó a cabo el taller “Herramientas Avanzadas en Simulación Biomolecular” entre el lunes 24 y el martes 25 de noviembre.

La jornada fue impartida por los destacados investigadores Sergio Pantano, del Instituto Pasteur de Montevideo (Uruguay), y Leandro Martínez, de la Universidad Estadual de Campinas (Brasil).

Ambos académicos cuentan con una amplia experiencia en el desarrollo e implementación de metodologías para el estudio computacional de sistemas biomoleculares.

Trabajo en equipo

Sergio Pantano explicó su interés en compartir “un trabajo que venimos realizando en mi grupo de Simulaciones Biomoleculares desde hace unos 10 años aproximadamente, que esencialmente permite realizar simulaciones moleculares de sistemas biológicos con un costo computacional reducido”.

La aplicación de estas metodologías ha permitido “estudiar la dinámica de partículas virales completas para entender cuáles son las fuerzas que las estabilizan o que eventualmente tienden a desestabilizarlas y facilitar infecciones”, sostuvo.

Otra línea de trabajo aborda procesos de agregación vinculados a enfermedades como el Alzheimer, por ejemplo.

La investigación científica para llegar a una cura definitiva de una enfermedad toma años, y es importante entenderlo.

Colaboración

En ese sentido, manifestó que “la idea es tratar de descifrar ciertos mecanismos moleculares que, eventualmente, en colaboración con otros grupos, pueden permitir el desarrollo de vacunas o curas para enfermedades”.

Para ello, es clave complementar o colaborar estrechamente con grupos experimentales, ya sea dentro del mismo instituto o con otros.

“Parte de eso es lo que estamos haciendo acá: tratar de extender lazos de cooperación con grupos en la universidad”, expresó.

Experimentando la simulación

Leandro Martínez compartió las herramientas que desarrolla en su grupo de investigación para analizar simulaciones moleculares de sistemas muy complejos en términos estructurales.

A pesar de que un virus parece una cosa muy pequeñita, estamos hablando de millones de átomos que se mueven en el espacio.

Agregó que lo que ellos hacen, es entender esos movimientos desde el punto de vista de la fisicoquímica a través de “herramientas computacionales para analizar las simulaciones y entenderlas desde el punto de vista molecular”.

Martínez aseguró que para ellos es clave compartir el conocimiento, “porque hay un nivel altísimo de investigación en toda Latinoamérica, pero tenemos la tendencia a interactuar con gente de Europa o de Estados Unidos”.

Aseguró que “realmente hay que estrechar los lazos en Latinoamérica porque tenemos el conocimiento, las herramientas y el capital humano para hacer investigación de primera línea y estas interacciones son importantes para eso”.

Este taller, encabezado por Verónica Jiménez, directora de Postgrado y Educación Continua de la Facultad de Ciencias Exactas, se enmarcó en las actividades de colaboración internacional del Proyecto FONDECYT 1250395, financiado por la Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo – ANID.